Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms