Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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