Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPD52P55327 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPD52P55327 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms