Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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