Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA4P48169 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms