Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms