Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGIRP43119 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms