Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAEP38570 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms