Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CHRNA7P36544 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms