Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT20P35900 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms