Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD13P35453 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms