Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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