Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms