Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms