Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALPIP09923 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALPIP09923 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALPIP09923 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALPIP09923 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALPIP09923 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALPIP09923 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALPIP09923 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPIP09923 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms