Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPIND1P05546 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms