Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCGP05129 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms