Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms