Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms