Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS11DO60235 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS11DO60235 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS11DO60235 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS11DO60235 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11DO60235 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms