Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCO2O43819 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCO2O43819 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCO2O43819 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms