Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC01387J3KSC0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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LINC01387J3KSC0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC01387J3KSC0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC01387J3KSC0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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