Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM227AF5H4B4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms