Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
USP17L23D6RBM5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms