Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms