Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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