Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144AA2RUR9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms