Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms