Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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