Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms