Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SFMBT1Q9UHJ3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms