Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms