Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms