Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFIP11Q9UBB9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms