Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms