Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms