Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf42Q9NWW7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms