Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR4Q9NPB9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR4Q9NPB9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms