Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms