Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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