Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms