Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms