Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms