Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms