Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms