Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms