Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C10orf90Q96M02 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms