Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms