Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms