Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOPT1Q96IL0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms